Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CASP9P55211 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CASP9P55211 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CASP9P55211 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP9P55211 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP9P55211 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP9P55211 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP9P55211 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CASP9P55211 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CASP9P55211 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms