Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AL137796.1-201ENST00000608190 577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 GNG2-216ENST00000615906 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP1P53384 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP1P53384 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms