Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HK3P52790 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HK3P52790 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HK3P52790 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms