Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB28P51157 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB28P51157 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB28P51157 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms