Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB5CP51148 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB5CP51148 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB5CP51148 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB5CP51148 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB5CP51148 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RAB5CP51148 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RAB5CP51148 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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RAB5CP51148 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB5CP51148 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB5CP51148 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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RAB5CP51148 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB5CP51148 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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