Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSRP3P50461 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CSRP3P50461 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms