Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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