Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
XCR1P46094 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
XCR1P46094 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
XCR1P46094 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms