Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR1BP42025 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms