Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM23P36406 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms