Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPC1P35052 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms