Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPS1P31327 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPS1P31327 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPS1P31327 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPS1P31327 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPS1P31327 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPS1P31327 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPS1P31327 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPS1P31327 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPS1P31327 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms