Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIP1P30622 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms