Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
DUSP1P28562 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
DUSP1P28562 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DUSP1P28562 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DUSP1P28562 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DUSP1P28562 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DUSP1P28562 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DUSP1P28562 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
DUSP1P28562 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DUSP1P28562 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
DUSP1P28562 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
DUSP1P28562 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms