Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MSX1P28360 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSX1P28360 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSX1P28360 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
MSX1P28360 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSX1P28360 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSX1P28360 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSX1P28360 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MSX1P28360 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MSX1P28360 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSX1P28360 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSX1P28360 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSX1P28360 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSX1P28360 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSX1P28360 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSX1P28360 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSX1P28360 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSX1P28360 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSX1P28360 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSX1P28360 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSX1P28360 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MSX1P28360 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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