Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXD10P28358 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms