Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTX3P26022 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTX3P26022 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms