Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FGFR3P22607 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FGFR3P22607 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms