Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRHP20396 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRHP20396 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRHP20396 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRHP20396 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms