Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLR2CP19387 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms