Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRAP18433 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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