Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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DEFA4P12838 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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DEFA4P12838 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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DEFA4P12838 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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DEFA4P12838 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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DEFA4P12838 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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DEFA4P12838 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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DEFA4P12838 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DEFA4P12838 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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