Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RHOP08100 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RHOP08100 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RHOP08100 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms