Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms