Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRT6BP04259 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms