Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPAG9O60271 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPAG9O60271 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPAG9O60271 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPAG9O60271 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPAG9O60271 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPAG9O60271 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPAG9O60271 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPAG9O60271 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SPAG9O60271 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPAG9O60271 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPAG9O60271 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPAG9O60271 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms