Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGTAO43765 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SGTAO43765 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SGTAO43765 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGTAO43765 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGTAO43765 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGTAO43765 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGTAO43765 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGTAO43765 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGTAO43765 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGTAO43765 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SGTAO43765 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms