Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNPHO15079 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TYW3-205ENST00000479111 1130 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNPHO15079 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNPHO15079 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNPHO15079 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNPHO15079 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNPHO15079 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms