Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms