Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ERVV-1B6SEH8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-1B6SEH8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-1B6SEH8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-1B6SEH8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-1B6SEH8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-1B6SEH8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-1B6SEH8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ERVV-1B6SEH8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-1B6SEH8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-1B6SEH8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ERVV-1B6SEH8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms