Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HACD1B0YJ81 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms