Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL33A6NCF5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms