Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PIAS3Q9Y6X2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PIAS3Q9Y6X2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms