Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SNX13Q9Y5W8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SNX13Q9Y5W8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SNX13Q9Y5W8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SNX13Q9Y5W8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SNX13Q9Y5W8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX13Q9Y5W8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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