Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC8Q9Y2L5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms