Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PHF11Q9UIL8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms