Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPASTQ9UBP0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms