Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRIT1Q9P2V4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LRIT1Q9P2V4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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