Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL28Q9NXS3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms