Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COMMD8Q9NX08 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms