Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CLN6Q9NWW5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN6Q9NWW5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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