Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC52A1Q9NWF4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC52A1Q9NWF4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms