Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TBCCD1Q9NVR7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms