Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMBRD1Q9NUN5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms