Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TREX1Q9NSU2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TREX1Q9NSU2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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