Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTPS2Q9NRF8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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