Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UBE2TQ9NPD8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms