Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RAB9BQ9NP90 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms