Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
USP29Q9HBJ7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms