Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMIM3Q9BZL3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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